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神秘的小RNA分子:第一个自然产生的,能调节选择性剪接的RNA


  市场动态     |      2023-12-21
摘要:在小鼠体内发现了一种神秘的小RNA分子,它在基因表达中起着至关重要的作用,可能是第一个被发现的新一类调控RNA的成员。
RNA(核糖核酸)最为人所知的是信使RNA (mRNA),它携带着基因信息的副本从细胞核到可以解码的地方,制造蛋白质分子。但RNA也有其他关键功能,包括通过各种小的非编码RNA来调节基因活性,这些小的非编码RNA的基因序列不用于产生蛋白质。
其中一种非编码RNA是名为4.5SH的小RNA,仅在小鼠和大鼠等小型啮齿动物中发现。它由其基因的多个拷贝产生的,导致每个细胞积累多达10,000个拷贝的RNA分子。
由北海道大学Shinichi Nakagawa教授领导的一个研究小组发现了4.5 SH RNA的新作用——在mRNA成熟过程中规避小鼠DNA中的突变。他们的研究结果发表在《分子细胞》杂志上。
4.5SH RNA对抗小鼠SINE B1的有害外显子作用
图1 4.5SH RNA对抗小鼠SINE B1的有害外显子作用
“4.5SH RNA是在20世纪70年代被发现的,尽管它丰富且存在于许多类型的组织中,但它的功能在40多年来一直是个谜,”Nakagawa教授说。
为了了解它的作用,研究人员在小鼠胚胎中制造了一些突变,这些突变导致4.5SH不能产生,结果发现这会导致小鼠在胚胎阶段过早死亡。
Nakagawa解释说:“众所周知,小鼠基因组中编码必需蛋白质的基因有许多致命的突变,4.5 SH RNA具有大量解毒这些突变的能力,从本质上讲,它是一种防止突变的天然基因疗法。”
对4.5SH RNA的结构分析表明,它由两个模块组成。一个作为传感器发现异常序列,另一个带来了一种工具,通过一种称为选择性剪接的过程阻止异常序列与mRNA的结合。
“据我们所知,这是第一个自然产生的RNA能够以明确的开/关方式调节选择性剪接的例子,我们的研究还表明,这种非编码RNA的很大一部分可能参与控制选择性剪接。”Nakagawa说。
4.5SH RNA是小鼠体内一种重要的物种特异性非编码RNA
图2 4.5SH RNA是小鼠体内一种重要的物种特异性非编码RNA
研究人员还能够使用4.5SH设计一个可编程的分子系统,该系统可以以选定的方式操纵细胞中的剪接。这可能成为一种新的、有用的基因工程工具。
“我们的发现表明了开发新的基因治疗药物的可能性,这种药物通过修改4.5 SH RNA的传感器模块来识别特定的基因突变,因此我们可能能够阻止与疾病相关的有毒区域的表达,”Nakagawa解释说。
参考资料
[1] Rei Yoshimoto, Yuta Nakayama, Ikuko Nomura, Ikuko Yamamoto, Yumeka Nakagawa, Shigeyuki Tanaka, Misuzu Kurihara, Yu Suzuki, Takehiko Kobayashi, Hiroko Kozuka-Hata, Masaaki Oyama, Mari Mito, Shintaro Iwasaki, Tomohiro Yamazaki, Tetsuro Hirose, Kimi Araki, Shinichi Nakagawa. 4.5SH RNA counteracts deleterious exonization of SINE B1 in mice. Molecular Cell, 2023; DOI: 10.1016/j.molcel.2023.11.019

 

摘要:在小鼠体内发现了一种神秘的小RNA分子,它在基因表达中起着至关重要的作用,可能是第一个被发现的新一类调控RNA的成员。
RNA(核糖核酸)最为人所知的是信使RNA (mRNA),它携带着基因信息的副本从细胞核到可以解码的地方,制造蛋白质分子。但RNA也有其他关键功能,包括通过各种小的非编码RNA来调节基因活性,这些小的非编码RNA的基因序列不用于产生蛋白质。
其中一种非编码RNA是名为4.5SH的小RNA,仅在小鼠和大鼠等小型啮齿动物中发现。它由其基因的多个拷贝产生的,导致每个细胞积累多达10,000个拷贝的RNA分子。
由北海道大学Shinichi Nakagawa教授领导的一个研究小组发现了4.5 SH RNA的新作用——在mRNA成熟过程中规避小鼠DNA中的突变。他们的研究结果发表在《分子细胞》杂志上。
4.5SH RNA对抗小鼠SINE B1的有害外显子作用
图1 4.5SH RNA对抗小鼠SINE B1的有害外显子作用
“4.5SH RNA是在20世纪70年代被发现的,尽管它丰富且存在于许多类型的组织中,但它的功能在40多年来一直是个谜,”Nakagawa教授说。
为了了解它的作用,研究人员在小鼠胚胎中制造了一些突变,这些突变导致4.5SH不能产生,结果发现这会导致小鼠在胚胎阶段过早死亡。
Nakagawa解释说:“众所周知,小鼠基因组中编码必需蛋白质的基因有许多致命的突变,4.5 SH RNA具有大量解毒这些突变的能力,从本质上讲,它是一种防止突变的天然基因疗法。”
对4.5SH RNA的结构分析表明,它由两个模块组成。一个作为传感器发现异常序列,另一个带来了一种工具,通过一种称为选择性剪接的过程阻止异常序列与mRNA的结合。
“据我们所知,这是第一个自然产生的RNA能够以明确的开/关方式调节选择性剪接的例子,我们的研究还表明,这种非编码RNA的很大一部分可能参与控制选择性剪接。”Nakagawa说。
4.5SH RNA是小鼠体内一种重要的物种特异性非编码RNA
图2 4.5SH RNA是小鼠体内一种重要的物种特异性非编码RNA
研究人员还能够使用4.5SH设计一个可编程的分子系统,该系统可以以选定的方式操纵细胞中的剪接。这可能成为一种新的、有用的基因工程工具。
“我们的发现表明了开发新的基因治疗药物的可能性,这种药物通过修改4.5 SH RNA的传感器模块来识别特定的基因突变,因此我们可能能够阻止与疾病相关的有毒区域的表达,”Nakagawa解释说。
参考资料
[1] Rei Yoshimoto, Yuta Nakayama, Ikuko Nomura, Ikuko Yamamoto, Yumeka Nakagawa, Shigeyuki Tanaka, Misuzu Kurihara, Yu Suzuki, Takehiko Kobayashi, Hiroko Kozuka-Hata, Masaaki Oyama, Mari Mito, Shintaro Iwasaki, Tomohiro Yamazaki, Tetsuro Hirose, Kimi Araki, Shinichi Nakagawa. 4.5SH RNA counteracts deleterious exonization of SINE B1 in mice. Molecular Cell, 2023; DOI: 10.1016/j.molcel.2023.11.019